мдамм, нашел оч нехорошый баг... даже не баг, а недосмотр создателей:
при указании в темплате header\'а тега 
1. Инфа сохраняется.
2. делаем рефреш, и видим что все ссылки (в т.ч. и ссылки с форм) в админ интерфейсе поддаются параметру 
 . тоесть я указал 
, (админ-папка в реале лежит тут 
http://site.ru/admin/), и получилось что ВСЯ панель админа ссылается на 
http://site.ru/file.php а не на 
http://site.ru/admin/file.php . 
Как это исправить я честно говоря не понял (темплаты лежат в мусюл?), а переустанавливать скрипт нехочется. 
так что совету в будующих версиях указывать полные ссылки до места назначения, тоесть 
http://site.ru/admin/file.php а не /admin.php