Да все очень просто...
ServerName sub.domain
ServerAlias sub.domain
DocumentRoot "d:/srv/home/freehost4x/bx"
ScriptAlias /cgi-bin/ "d:/srv/home/domain/sub/cgi-bin/"
ErrorLog d:/srv/home/domain/sub/logs/error.log
CustomLog d:/srv/home/domain/sub/logs/access.log combined
так у меня сделано.
И не забыть добавить в \\WINNT\\system32\\drivers\\etc\\hosts
соответсвуюшую строчку и перезапустить апач.