Попробуй так:
$db = "you_database";
$res = mysql_query("SHOW TABLES FROM ".$db);
if(mysql_num_rows($res))
{
while($ln = mysql_fetch_array($res))
{
$tables[] = $db.".".$ln[\'Tables_in_\'.$db];
}
$list_tables = implode(",",$tables);
mysql_query("DROP TABLE ".$list_tables);
echo "Ok! Все прибили!";
}
else echo "Нихрена нет таблиц!!!";