mysql в PHP5 будет поддерживаться, но не будет встроена
нужно будет Php_extension=php_mysql.dll - сейчас библиотека неправильно грузится, и PHP5 beta как IIS-isapi модуль "вырубает" IIS
Кстати, в текущем бета-дистрибутиве PHP5 библиотеки php_mysql.dll по-просту нет.
Но будет скоро - верьте!