статические страницы генерить не хочется, т.к это приведет к захламлению кучей файлов. Да и SSI использовать не вижу смысла, пусть все полностью на perl будет.
Разделить тоже было бы не очень правильно. Хотелось бы зделать единый интерфейс. Просто кроме weblog там еще и другие скрипты будут подобным образом использоваться.
А нельзя ли вызывать view.cgi и comments.cgi локально без обращения к apache?