По поводу mod_rewrite пойду посмотрю, но первая мысль, какая пришла в голову - прописать в локальной директории .htaccess c нужной строчкой:
Action text/html /cgi-bin/my_script_html_handler.cgi
Ну и куда положишь, там все html файлы, будут через обработчик шпарить.