слишком много пустого места наверху по сравнению с серединой
Со временем там скорее всего будет баннер ... или еще что.
не понятно где основная навигация
Хм, а что тут непонятного, там только 1 навигационная панель.
я бы не делал шрифт текста больше чем шрифт меню
Дело в том, что мне не нравиться как выглядит 12 Вердана в меню и вообще в блоках, поэтому там 11, тем более было сделано так, что бы несмотря на это не чувствовалось отчужденности и было максимально читабельно.