Всем спасибо. Сам догнал.
$dec = str_replace("\\n","",$dec);//удаляем символы абзаца
$dec = str_replace("\\r"," ",$dec);//меняем на пробел символы возврата каретки
После этого строка $dec представляет собой одну длинную строку. Она и хранится в файле.