Если сервер - Апач и можно пользовать .htaccess то можно обойтись без скриптов.
А можно и скрипт написать. Вместо показа ссылок для скачивания, отдавай файлы скриптом, проверяя каким браузером зашел юзер. Ну и на основании проверки делай вывод отдавать или нет файл.