Вообще то первым делом отключить машину от интернета и смотреть логи до выяснения возможного сценария атаки.
Вторым делом забить на IIS и винду и поселиться на нормальной серверной системе с апачем.
Третим делом, если первые два не увенчались успехом, просмотреть сервер на открытые порты и позакрывать все нафиг (в том числе и фтп) кроме 80.