Можно так
$string=ereg_replace(\'Матрица 2: Перезагрузка\',\'<a href=index.php?idfilm=896>Матрица 2: Перезагрузка</a>\',$string);
$string=ereg_replace(\'([^>])Матрица\',\'\\\\1<a href=index.php?idfilm=159>Матрица</a>\',$string);
а можно и так
$string=ereg_replace(\'Матрица 2: Перезагрузка\',\'<a href=index.php?idfilm=896>Матрица 2: Перезагрузка</a>\',$string);
$string=ereg_replace(\'Матрица ([^2])\',\'<a href=index.php?idfilm=159>Матрица</a> \\\\1\',$string);