Так что, кто-то где-то прогнал
Я лично использую прогу WS_FTP95, в этой проге когда я делаю chmod, то в не надо ставить галочки, а так же в этой проге не показывает файлы(которые находятся на сервере) такие как .htaccess
А про скрытые файлы это в опциях в проге SmartFTP видел, это опция для того что бы показывать пользователю скрытые файлы такие как .htaccess.
Что касается
архивный, то я не видел ни в какой проге этого.