Граждане! Только сейчас разобрался, в чем проблема была - данные папки, принадлежащие PHPNuke, не могли быть удалены посредством FTP менеджера, но "напрямую" через Control Panel хостинга удалились без дополнительных вопросов (если не считать вопрос "Вы уверены?")
Спасибо!